Funkcionalni i metabolički markeri omogućavaju detaljniji uvid u procese koji se odvijaju u organizmu i doprinose razumevanju njegovog metaboličkog i fiziološkog statusa. Njihova analiza može pružiti značajne informacije o ravnoteži između oksidativnih procesa i antioksidativne zaštite, funkciji imunološkog sistema i aktivnosti specifičnih enzima uključenih u različite biološke procese.

U okviru ove grupe analiza izdvajaju se markeri poput glutationa, hitotriozidaze i parametara oksidativnog stresa. Glutation ima važnu ulogu u ćelijskoj antioksidativnoj zaštiti, hitotriozidaza je enzim čija aktivnost može biti povezana sa određenim procesima imunološkog odgovora, ali je ujedno i najspecifičniji biomarker sarkoidoze, dok markeri oksidativnog stresa pružaju uvid u ravnotežu između stvaranja slobodnih radikala i sposobnosti organizma da neutrališe njihove efekte.

Rezultati ovih analiza mogu doprineti sveobuhvatnijoj laboratorijskoj proceni i boljem razumevanju određenih fizioloških i patofizioloških procesa. Njihovo tumačenje zavisi od vrste analiziranog markera, kliničke slike i drugih relevantnih laboratorijskih nalaza, zbog čega predstavljaju dopunu, a ne zamenu za celokupnu kliničku procenu.